蛋白质功能基团三维模体及其应用 |
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引用本文: | 叶玉珍,解涛,丁达夫.蛋白质功能基团三维模体及其应用[J].科学通报,2000,45(12):1243-1251. |
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作者姓名: | 叶玉珍 解涛 丁达夫 |
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作者单位: | 中国科学院上海生物化学研究所,上海200031 |
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基金项目: | 国家“863”生物高技术项目!(批准号:863-103-03-03), 国家自然科学基金重大项目!(批准号:39990600-0 |
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摘 要: | 用一维序列模体和三维结构模体刻画与识别蛋白质功能区是蛋白质功能预测和分子设计中的重要课题。目前三维模体的提取与搜索均以残基为单位进行。特异性有限。鉴于残基的功能基团才是其发挥功能的关键要素,提出以功能基团为单位来表征三维模体(称为功能基团三维模体),并发展了相应的搜索算法,用于阐释蛋白质功能的结构基础以及预测未知蛋白质的功能。以从胰蛋白酶(PDB代码为1mct)中提取的“三联体和氧穴”功能基团三维
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关 键 词: | 功能基团三维模体 期望值 功能预测 蛋白质 |
收稿时间: | 1999-11-22 |
修稿时间: | 2000-04-24 |
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