基于LGC的lncRNA-疾病关联预测

针对现有预测模型的局限性，结合图卷积推荐算法提出一种预测lncRNA和疾病关联关系的模型LGCLDA,使用疾病相关的lncRNA、基因和miRNA信息，构建疾病综合特征。利用图进行疾病信息嵌入提取，实现对潜在与疾病相关的lncRNA的推荐。在相同数据集上采用五折交叉验证法与现有预测模型MHRWR、 SIMCLDA、 ILNCSIM进行比较，提出的模型将AUC值分别提高了15.9%、8.8%、67.0%。对乳腺癌进行了详细的案例研究，预测结果得到了最近的生物医学文献的证明，进一步表明了算法的有效性。