| OFFGEL和LC-MS联用分析SH-SY5Y 细胞分泌蛋白质组 |
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| 作者姓名： | 张永谦 来成俊 李琰 卡里姆 邓玉林 |
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| 作者单位： | 1. 北京理工大学生命学院,北京,100081
2. 河北化工医药职业技术学院,河北,石家庄050026 |
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| 基金项目： | 北京理工大学研究生科技创新基金资助项目(AA200805) |
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| 摘 要： | 建立了游离胶分馏器(OFFGEL)和反相液相色谱质谱(LC-MS)联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组的新方法.收集SH-SY5Y胞外蛋白用胰酶酶切成肽段后,用OFFGEL进行预分离并用LC-MS进行检测.用Mascot检索出88个蛋白,再通过生物信息学软件SignalP对Mascot检索的蛋白进行预测和筛选,共得到31种蛋白,用SingalP中的神经网络法和隐马可夫模型对其中的CERU_HUMAN进行分析,发现该蛋白是分泌蛋白,且信号肽的剪切位点在第19和第20氨基酸之间,软件SingalP提升了鉴定分泌蛋白的可靠性.
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| 关 键 词： | 分泌蛋白组 游离胶分馏器 液相色谱质谱 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2010-12-15 |
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