基因组AFLP分析及线粒体12SrRNA序列变异在笛鲷科系统发育上的比较 |
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引用本文: | 张俊彬,刘昕.基因组AFLP分析及线粒体12SrRNA序列变异在笛鲷科系统发育上的比较[J].科学通报,2006,51(B11):120-124. |
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作者姓名: | 张俊彬 刘昕 |
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作者单位: | 中国科学院广东省海洋应用生物技术重点实验室、中国科学院南海海洋研究所热带海洋环境动力学开放实验室,广州510301 |
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基金项目: | 本工作为国家自然基金项目(批准号:40306022)和广东省自然科学基金项目(编号:04001300)资助. |
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摘 要: | 以10种笛鲷科鱼类和1种纵带裸颊鲷为对象,采用ABI PRISM 310测序仪进行基因组AFLP分析,并结合线粒体12S rRNA序列变异对笛鲷科系统发育开展比较研究.结果显示:除了紫鱼属和梅鲷属鱼类外,这两种方法构建的最小进化树(ME)的拓扑结构基本上是一致的,而且具有较高的自展值(bootstrap),其揭示的笛鲷科系统发育关系也为最大似然法(ML)支持.基于线粒体12S rRNA序列进行最大似然法分析表明,笛鲷科系统发育最适合的替代模型为TrN+G,对数似然比检验表明,分子钟是被接受的.AFLP遗传标记适合于笛鲷科及以下水平的系统发育分析.研究表明,笛鲷属可能为一单系,但其他属的系统发育关系还需要更多资料进一步验证.
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关 键 词: | 笛鲷科 系统发育 基因组 线粒体 12S rRNA AFLP |
收稿时间: | 2006-02-27 |
修稿时间: | 2006-02-272006-07-27 |
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