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概率密度函数的特征相关法DNA序列分析
引用本文:罗代升,罗辑,谢明,吴晓红,余艳梅. 概率密度函数的特征相关法DNA序列分析[J]. 四川大学学报(自然科学版), 2006, 43(2): 334-340
作者姓名:罗代升  罗辑  谢明  吴晓红  余艳梅
作者单位:四川大学电子信息学院,成都,610064;四川大学电子信息学院,成都,610064;四川大学电子信息学院,成都,610064;四川大学电子信息学院,成都,610064;四川大学电子信息学院,成都,610064
摘    要:提出了一种客观的特征提取和相关的方法用于DNA序列的结构分析.这种方法是从DNA序列码的碱基和片段码中提取统计特征和相关特征.然后计算样本序列和已知类之间的平均相关系数.如果最大的相关系数大于对应类的平均相关系数,则该样本被分类到对应的类中去.利用一组DNA序列样本做了试验,结果表明,这种方法适合于任何DNA序列的结构分析而不需要先念的生物信息,对发掘人类基因隐藏信息的研究大有用处。

关 键 词:生物信息解译  DNA序列结构分析  特征提取  模式分类
文章编号:0490-6756(2006)02-0334-07
收稿时间:2005-04-16
修稿时间:2005-04-16

Analysis of DNA Sequences Using Feature Correlation of Probability Density Function
LUO Dai-sheng,LUO Ji,XIE Ming,WU Xiao-hong,YU Yan-mei. Analysis of DNA Sequences Using Feature Correlation of Probability Density Function[J]. Journal of Sichuan University (Natural Science Edition), 2006, 43(2): 334-340
Authors:LUO Dai-sheng  LUO Ji  XIE Ming  WU Xiao-hong  YU Yan-mei
Abstract:Propose an unbiased method of feature extraction and classification for DNAsequenceanalysis.In the method,statistical and correlationfeatures are extractedfromraw DNAsequencedata and the mean correlationfeatures of a sample DNAsequence to all given classes are calculat-ed.If the maxi mal mean correlation feature exceeds the mean correlation feature of an existingclass,the sampleis groupedintothe corresponding class.Otherwise,it is groupinto a newclass.Using a set of sample DNAsequences,we demonstrate that t...
Keywords:bioinformatics   DNAsequence analysis   feature extraction   pattern classification
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