| 基于CDS..join特征域的Exon/Intron数据库的构建 |
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| 引用本文： | 金鹰,邓小元.基于CDS..join特征域的Exon/Intron数据库的构建[J].华南师范大学学报(自然科学版),2009,1(1):91. |
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| 作者姓名： | 金鹰 邓小元 |
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| 作者单位： | 1.华南师范大学光电学院 |
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| 摘 要： | 基因进化的研究和重构通常是在序列水平上进行的，包括比对它们的遗传序列或蛋白序列。而对基因外显子/内含子结构的分析能够提供更多有价值的信息，比如绘制更为可靠的系统发生图谱，或更精确地阐明内含子的进化。为此，本文设计了相应的Perl脚本程序来提取、比较和搜索基因说明文档中CDS..join特征域的Exon/Intron结构。通过该方法，可构建相关物种的Exon/Intron数据库（EID），其主要内容包括内含子的相位，Exon或Intron的数量、大小，剪接位点的模式以及选择性剪接（Alternative splicing, AS）的相关信息。
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| 关 键 词： | 编码序列 外显子 内含子 外显子/内含子数据库 选择性剪接 |
| 收稿时间： | 2008-07-17 |
CONSTRUCTION OF EXON/INTRON DATABASE(EID) BASED ON CDS..JOIN FEATURES |
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| JIN Ying,DENG Xiao-yuan.CONSTRUCTION OF EXON/INTRON DATABASE(EID) BASED ON CDS..JOIN FEATURES[J].Journal of South China Normal University(Natural Science Edition),2009,1(1):91. |
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| Authors: | JIN Ying DENG Xiao-yuan |
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| Institution: | School of Information and Photoelectron;South China Normal University;Guangzhou;510631;China |
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