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多鳍鱼Shh基因克隆与同源性分析
引用本文:张昌盛,刘群,李湘涛,翟红,王俊杰,孙永华. 多鳍鱼Shh基因克隆与同源性分析[J]. 科技导报(北京), 2007, 25(12): 23-27
作者姓名:张昌盛  刘群  李湘涛  翟红  王俊杰  孙永华
作者单位:中国农业大学动物医学院,北京,100094;北京自然博物馆,北京,100050;中国农业大学动物医学院,北京,100094;北京自然博物馆,北京,100050
基金项目:北京市科学技术研究院萌芽计划项目资助
摘    要:根据已报道的软骨鱼、硬骨鱼、两栖类、鸟类、哺乳类和人的Sonichedgehog(Shh)基因序列,在Shh基因保守区设计一对简并性引物,利用PCR技术从多鳍鱼cDNA中扩增Shh基因。结果显示,多鳍鱼Shh基因全长1263bp,编码421个氨基酸。通过同源性比较发现,多鳍鱼与肺鱼的同源性最高,为82.5%,二级结构分析表明,Shh蛋白含有30.71%的α螺旋,21.67%的扩展线条和47.62%的无规卷曲,不含β片层;并以蛋白质结构数据库(PDB)中已解析的Shh蛋白的三维结晶结构(3D)为模板,利用http://www.expasy.org/swissmod/SWISS-MODEL.html同源模建Shh蛋白的三维结构,为进一步研究Shh基因在胚胎体节发育和肢芽图式形成中的功能奠定了基础。

关 键 词:多鳍鱼  Shh基因  分子进化  同源性分析
文章编号:1000-7857(2007)12-0023-05
修稿时间:2007-03-24

Cloning and Polymorphistic Analysis of Shh Gene from Senegal Bichir
ZHANG Changsheng,LIU Qun,LI Xiangtao,ZHAI Hong,WANG Junjie,SUN Yonghua. Cloning and Polymorphistic Analysis of Shh Gene from Senegal Bichir[J]. Science & Technology Review, 2007, 25(12): 23-27
Authors:ZHANG Changsheng  LIU Qun  LI Xiangtao  ZHAI Hong  WANG Junjie  SUN Yonghua
Abstract:
Keywords:senegal bichir  Shh gene  molecular evolution  polymorphistic analysis
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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