| 基于TCGA数据库前列腺癌预后相关mRNA风险模型的构建 |
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| 引用本文： | 张汉荣,林联拯,赵力,于忠英,李金雨. 基于TCGA数据库前列腺癌预后相关mRNA风险模型的构建[J]. 渤海大学学报(自然科学版), 2021, 42(1): 78-83. DOI: 10.3969/j.issn.1673-0569.2021.01.013 |
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| 作者姓名： | 张汉荣 林联拯 赵力 于忠英 李金雨 |
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| 作者单位： | 中国人民解放军联勤保障部队第909医院(厦门大学附属东南医院)泌尿外科,福建漳州363000 |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法,深入分析TCGA基因组数据库,利用数据库的前列腺癌全转录组数据构建前列腺癌的风险模型.对TCGA数据库收录的492例前列腺癌癌组织和52例癌旁组织做基因差异分析,筛选出差异基因后进一步对上调基因做GO功能富集分析和KEGG通路富集分析.以上调最明显的10个基因做为候选基因,进一步分析各基因对前列腺癌患者预后的影响.最后,使用COX风险回归模型,构建多基因的COX回归风险模型.结果表明基因表达差异分析共筛选表达上调基因1978个,下调基因1644个.其中上调最明显的基因为:PCA3、AMACR、MTND4P12、RNY3P8、DLX1、OR51E2、PCAT14、GOLM1、HPN、GLYATL1.生存分析结果提示高表达 PCA3、MTND4P12、RNY3P8、OR51E2、PCAT14、GOLM1 均提示前列腺癌预后不良.基于上述6个基因,构建的风险模型对前列腺癌风险具有良好的预测精度.可筛选出前列腺癌患者中高风险的患者.PCA3、MTND4P12、RNY3P8、OR51E2、PCAT14、GOLM1在前列腺癌组织中高表达,且高表达该基因提示预后不良.提示,上述基因可能在前列腺癌的发生、发展中发挥重要的作用.
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| 关 键 词： | 前列腺癌 生物信息学 信使RNA COX风险模型 TCGA数据库 |
Construction of mRNA risk model related to prognosis of prostate cancer based on TCGA database |
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| ZHANG Hanrong,LIN Lianzheng,ZHAO Li,YU Zhongying,LI Jinyu. Construction of mRNA risk model related to prognosis of prostate cancer based on TCGA database[J]. Journal of Bohai University:Natural Science Editio, 2021, 42(1): 78-83. DOI: 10.3969/j.issn.1673-0569.2021.01.013 |
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| Authors: | ZHANG Hanrong LIN Lianzheng ZHAO Li YU Zhongying LI Jinyu |
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