RS-GA-KNN算法识别灵长类动物DNA序列剪接位点 |
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作者姓名: | 张运陶 丁保淼 黎云祥 |
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作者单位: | 西华师范大学,应用化学研究所,四川,南充,637002;西华师范大学,生命科学学院,四川,南充,637002 |
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摘 要: | 以灵长类动物DNA序列的剪接位点识别资料为研究对象,将选定样本序列中各碱基编码作为原始变量数据,用粗糙集方法和遗传算法对原始变量数据进行变量筛选,即以粗糙集方法选取的变量为基础,用遗传算法进行变量的二次搜索,从样本序列各碱基中挑选出保守性强的碱基对应的变量构成变量集,采用最近邻聚类识别灵长类动物DNA序列剪接位点类型,总识别准确率达90.66%,明显高于直接使用原始变量数据或将粗糙集理论方法和遗传算法单独用于变量选取的识别结果.
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关 键 词: | 粗糙集理论 遗传算法 最近邻聚类 剪接位点 识别 |
文章编号: | 1000-1190(2006)01-0090-05 |
收稿时间: | 2005-10-25 |
修稿时间: | 2005-10-25 |
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