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暗紫贝母甲羟戊酸途径关键酶HMGR的生物信息学分析
作者姓名:许勇  戴陈伟  蔡标
作者单位:安徽省医学科学研究院微生物研究所
摘    要:以暗紫贝母的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶氨基酸序列为研究对象,利用CD search、Cell-PLoc和SWISS-MODEL等生物信息学在线预测软件对其保守区域、理化性质、亚细胞定位、结构和活性区域等性质进行分析.结果表明,该酶由559个氨基酸残基组成,是主体部分位于内质网膜外的二次跨膜疏水蛋白质.其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成.三级结构为同源四聚体结构,活性区域由两条多肽链的66个氨基酸残基构成,活性区域的面积和体积分别为1 284.340?~2和2 152.618?~3.生物信息学手段分析预测结果揭示了暗紫贝母中3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶的性质、结构和功能,为进一步研究贝母活性生物碱的生物合成调控机制奠定理论基础.

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