G蛋白偶联受体119活性位点预测及与吡唑并嘧啶类激动剂对接研究 |
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作者姓名: | 赵倩男 程雅迪 钱艳椿 荣学滨 曹洪玉 |
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作者单位: | 大连大学生命科学与技术学院; |
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摘 要: | 利用同源模建的方法构建GPR119蛋白三维结构,经多种方法优化并用Profiles-3D和拉氏图评估后,得到最优蛋白模型,计算分析得到5个可能的活性位点,分析其活性位点氨基酸组成情况,发现了潜在保守序列.构建并优化了吡唑并嘧啶类药物小分子,其最低能量结构采用最陡下降法和共轭梯度法进行优化.将药物小分子逐一对接至蛋白的各个活性位点,得到二者相互作用模型.根据作用模型分析了此类药物小分子与活性位点之间的氢键、静电作用力等.
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