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| 无蹼壁虎EMC3基因cDNA全长克隆与进化分析 | |
| 作者姓名： | 夏龙杰 吴海霞 时昕晔 严洁 李鹏 |
| 作者单位： | 1. 南京师范大学生命科学学院;2. 南京师范大学海洋科学与工程学院 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31000954）;;江苏省高等学校自然科学研究重大项目（19KJA330001）;;江苏省研究生科研与实践创新计划项目（KYCX20＿1241）; |
| 摘 要： | 为了探究无蹼壁虎(Gekko swinhonis)EMC3基因(命名为GsEMC3)的序列特征,了解GsEMC3蛋白的结构和功能,探讨GsEMC3蛋白与其他物种EMC3蛋白的进化关系,采用SMART RACE技术克隆获得了GsEMC3的全长cDNA序列,通过信息学分析阐明了GsEMC3基因的序列特征以及GsEMC3蛋白的结构和功能,系统发育和选择压力分析研究了GsEMC3的进化特征. GsEMC3基因的cDNA全长为1 023 bp,包含1个786 bp的开放阅读框,基因编码1个含261个氨基酸的多肽. GsEMC3蛋白的相对分子质量约为30.074×103,理论等电点为5.57.生物信息学分析表明,无蹼壁虎GsEMC3为疏水性非分泌型蛋白,有2个跨膜区,可能是一个动态定位的蛋白,无信号肽,直接在细胞内发挥作用.其分子量与已知的其他物种的EMC3蛋白相近. GsEMC3蛋白含有1个DUF106结构域,二级结构包含12个α-螺旋、1个β-折叠、13个无规则卷曲.系统发育分析表明,无蹼壁虎GsEMC3蛋白序列与美国短吻鳄(Alligator mississippien... |
| 关 键 词： | 无蹼壁虎 GsEMC3基因 cDNA 序列分析 选择压力 |