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水稻OsMDH基因的克隆及其生物信息学分析
作者姓名:彭波  孙晓宇  张庆茜  彭娟  娄安琪  孙艳芳  庞瑞华  周伟  汪全秀
作者单位:1. 信阳师范学院生命科学学院/大别山农业生物资源保护与利用研究院;2. 信阳市植保植检站
基金项目:国家自然科学基金项目(U2004141,31801332);;河南省科技攻关项目(222102110141,192102110119);;河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2019GGJS162);;河南省高等学校重点科研项目(21A180001,20B180013);
摘    要:水稻(Oryza sativa L.)OsAAP6基因是控制水稻种子蛋白质含量的主效数量性状座位(quantitative trait locus, QTL)基因,对水稻品质性状产生重要影响,而OsMDH蛋白能够与OsAAP6基因发生相互作用。利用生物信息学策略对OsMDH蛋白的理化性质、蛋白结构及功能进行预测,探究OsMDH基因的生物学功能。结果表明:水稻OsMDH基因的编码区(coding sequence, CDS)区长999 bp,编码332个氨基酸;编码蛋白为疏水蛋白且不存在信号结构,包含两个跨膜结构。通过蛋白互作分析,发现OsMDH可能与柠檬酸合酶、延胡索酸酶等发生相互作用,参与三羧酸循环过程。

关 键 词:水稻  OsMDH基因  结构域功能  生物信息学分析
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