沼泽红假单胞菌砷代谢基因多样性及进化分析 |
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作者姓名: | 郭少伟 吕常江 张意 赵春贵 |
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作者单位: | 华侨大学化工学院;浙江大学化学工程与生物工程学系 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31070054,31270106);福建省自然科学基金资助项目(2010J01209,2012J01136) |
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摘 要: | 对已公布全基因组的沼泽红假单胞菌(Rhodopseudanonas palustris)砷代谢基因进行解析,探求其砷代谢机制及进化关系.已公布全基因组的7个菌株中均含有砷抗性(ars)基因簇,主要包括arsR,arsC,arsM,arsB,acr3p,arsH,但不同菌株间的arsR同源性可以有较大差异,有6个菌株同时含有Ⅰ和Ⅱ两类arsC,5个菌株含有arsM,arsM同源性也有较大差异.结果表明:R.palustris砷代谢机制的主体为细胞质As(Ⅴ)还原和As(Ⅲ)甲基化,菌株不同,砷代谢基因呈现明显差异和多样性.
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关 键 词: | 沼泽红假单胞菌 砷抗性 基因簇 生物信息学 |
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