| 蛋白质二级结构中对应的密码子关联的进一步讨论 |
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| 引用本文： | 胡秀珍,李前忠.蛋白质二级结构中对应的密码子关联的进一步讨论[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2005,36(3):294-300. |
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| 作者姓名： | 胡秀珍 李前忠 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理系,呼和浩特,010021;内蒙古工业大学物理系,呼和浩特,010062;内蒙古大学物理系,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30160025)，内蒙古工业大学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 从概率论的角度出发,以人和大肠杆菌蛋白质为模式,研究了蛋白质二级结构中有显著统计意义的mRNA序列上的密码子上下文关联,以及蛋白质序列上的氨基酸上下文关联.从而给出了99%置信水平上的各二级结构中的反常密码子上下文关联偏好型.为了进一步检查反常密码子关联对二级结构的影响是否有位点保守性,研究了密码子上下文关联以及氨基酸上下文关联与二级结构位点的关系,结果显示反常密码子关联与二级结构位点没有强关联.所得结果可以给出哪些密码子的上下文关联对蛋白质二级结构有影响,且对改进蛋白质二级结构的预测有一定的参考价值.
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| 关 键 词： | 蛋白质二级结构 同义密码子 统计关联 氨基酸序列 mRNA序列 |
| 文章编号： | 1000-1638(2005)03-0294-07 |
| 修稿时间： | 2004年6月9日 |
The Further Discussion for Context Correlation of Codons in Secondary Structures of Proteins |
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| HU Xiu-zhen,LI Qian-zhong.The Further Discussion for Context Correlation of Codons in Secondary Structures of Proteins[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2005,36(3):294-300. |
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| Authors: | HU Xiu-zhen LI Qian-zhong |
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| Institution: | HU Xiu-zhen~ |
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| Keywords: | secondary structures of protein synonymous codon statistical correlation amino-acid sequence mRNA sequence |
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