| 应用离散增量方法识别人类 MicroRNAs 前体序列 |
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| 引用本文： | 高智红,张利绒,罗辽复.应用离散增量方法识别人类 MicroRNAs 前体序列[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2010,41(6). |
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| 作者姓名： | 高智红 张利绒 罗辽复 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，内蒙自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | MicroRNAs(miRNAs)是一类约为21-26个碱基长度的非编码单链RNA.根据MicroRNAs前体序列(pre-miRNAs)的碱基保守特征和二级结构特征,应用多样性增量方法(ID方法)和支持向量机(SVM)分析,以内含子区(intron)、外显子区(exon)、基因间区(intergenic)三类序列分别作为负集,对人类的pre-miRNAs进行分析和预测.当以intergenic区和intron区序列为训练负集时,其以二级结构三联体、四联体和五联体(3-mer、4-mer、5-mer)为特征参量的敏感性、特异性、整体精度都在89%以上,相关系数在0.7以上.
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| 关 键 词： | pre-miRNAs 离散增量 二级结构特征 |
Identification of Human MicroRNAs Precursor Sequences by ID Methods |
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| GAO Zhi-hong,ZHANG Li-rong,LUO Liao-fu.Identification of Human MicroRNAs Precursor Sequences by ID Methods[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2010,41(6). |
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| Authors: | GAO Zhi-hong ZHANG Li-rong LUO Liao-fu |
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