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| 多种方法研究6-吡咯脱氧胞苷的发夹结构 |
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| 引用本文： | 孙凌志,张旭 .多种方法研究6-吡咯脱氧胞苷的发夹结构 [J].重庆师范大学学报(自然科学版),2016(6):120-126. |
| 作者姓名： | 孙凌志 张旭 |
| 作者单位： | 盐城师范学院 药学院,江苏 盐城224051 |
| 摘 要： | 为更好地了解DNA发卡结构在生物学上的功能,利用时间分辨荧光光谱和2D-NOENMR谱确定6-吡咯脱氧胞苷(6PdC)的二级结构,用滴定曲线测定7-氨基放线菌素D(7AAMD)滴定DNA的Kd值,并用Z-DOCK方法计算7AAMD与DNA的绑定位置。结果显示,6PdC的表观时间分辨寿命为1.44ns,而7-吡咯脱氧胞苷(7PdC)的该寿命为2.81ns;在2D-NOENMR谱中处于H8/H6区域的交叉峰,除了处于7,8,9,10位上的脱氧胞苷(dC)的NOE很弱甚至难以观察到外,其他的dC的NOE交叉峰很强,并且可以很好地归属;滴定曲线显示AACC4,7PdC,6PdC,AACC4-comp等与7AAMD的Kd值分别是0.1,0.31,0.46,0.57;Z-DOCK计算结果显示7AAMD的平面多环插入发夹环。研究结果说明DNA的结构决定7AAMD与自身亲和力的强弱,而吡咯脱氧胞苷(PdC)的空间位阻的影响有限;揭示7AAMD可能通过与启动子或增强子的发夹部位结合抑制或减弱原癌基因的转录水平,达到抗癌作用。 |
| 关 键 词： | 发夹结构 时间分辨荧光光谱 2D-NOE核磁共振 7-氨基放线菌素D 分子动力学模拟计算 6-吡咯脱氧胞苷 |
Study of the Hairpin Structure of 6PdC via Multiple Methods |
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| SUN Lingzhi,ZHANG Xu .Study of the Hairpin Structure of 6PdC via Multiple Methods [J].Journal of Chongqing Normal University:Natural Science Edition,2016(6):120-126. |
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| Authors: | SUN Lingzhi ZHANG Xu |
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