| 志贺氏菌属各亚群菌株基因组“共有骨架”组成的分析 |
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| 作者姓名： | 刘红 彭俊平 杨剑 孙立连 陈淑霞 金奇 |
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| 作者单位： | 1. 山东大学微生物技术国家重点实验室
2. 病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176 |
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| 基金项目： | 本工作为国家重点基础研究发展规划(批准号: G1999054105)、国家高技术研究发展计划(批准号: 2001AA223011)资助项目及国际科技合作重点项目(批准号: 2001AA223116)和北京市科技项目(合同号: H0102- 10360119). |
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| 摘 要： | 不同原核生物在基因组组成上的差异是其生物学性状差异的基础. 然而，进化中亲缘关系较近的菌群, 其基因组除了含有群或株特异的基因外, 还含有反映它们起源和进化痕迹的“共有骨架”结构, 而这些“共有骨架”恰恰是它们基本生存能力和共有生物学性状的基础. 志贺氏菌在起源和进化上与大肠杆菌极为密切, 目前倾向于将二者划为同一个种. 利用大肠杆菌K-12全基因组及Sf301特异性ORFs的芯片研究了志贺氏菌4个群间的基因组组成. 结果显示, 分别有16%~22% K-12的ORFs序列没有在志贺氏菌的基因组中被检测出, 而志贺氏菌的基因组中包含至少2800个保守的ORFs, 组成了其共有的“共有骨架”. 进一步分析提示, 这些“共有骨架”是维持肠道细菌正常生命生理活动所必需的基本组成. 此外, 只有20%的Sf301特异性ORFs同时存在于其他3个菌株中, 揭示了各菌株间基因组的异质性和菌属内的遗传多样性.
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| 关 键 词： | 志贺氏菌属 大肠杆菌K-12 全基因组微阵列 骨架序列 |
| 收稿时间： | 2003-06-03 |
| 修稿时间： | 2003-06-03 |
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