并行计算在分子模拟中的应用 |
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引用本文: | 王俊,丁皓,朱宇,陆小华,吴锤结.并行计算在分子模拟中的应用[J].南京工业大学学报(自然科学版),2003,25(1):9-13. |
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作者姓名: | 王俊 丁皓 朱宇 陆小华 吴锤结 |
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作者单位: | 1. 南京工业大学,化学化工学院,江苏,南京,210009 2. 解放军理工大学,理学院,江苏,南京,211101 |
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基金项目: | 国家杰出青年基金(No.29925616)、江苏省自然科学基金(BK2002016) |
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摘 要: | 简要介绍了并行计算机的发展背景,结合网络中心搭建的Linux cluster并行机说明了此类并行机的基本架构。对三款常用的并行分子模拟软件进行了评述,比较了不同架构并行机的运行效率。对其中一款软件在此并行机上进行了实测,并对并行机和分子模拟软件的发展进行了合理的预测。
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关 键 词: | 并行计算 分子模拟 分子动力学 并行计算机 计算化学 |
文章编号: | 1671-7643(2003)01-0009-05 |
Application of parellel computer in promoting development of molecular simulation |
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