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不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究
引用本文:林瀚,黄亚志,张尚宏.不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究[J].中山大学学报(自然科学版),2011,50(3).
作者姓名:林瀚  黄亚志  张尚宏
作者单位:中山大学基因工程教育部重点实验室//生物工程研究中心,广东广州,510275
基金项目:国家自然科学基金资助项目,广东省自然科学基金资助项目,国家973计划资助项目,国家人才基金(基地)项目
摘    要: 对原核生物基因组的研究显示,基因组GC含量与基因组大小和氧气偏好性等因素存在着一定的相关性。为了探索基因组大小与GC含量的相关性是否受原核生物生活习性的影响,选取了有代表性的411种原核生物(包括古细菌与真细菌),分别从最适生长温度、氧气偏好性、运动特性、水生特性和寄生特性等因素进行分析,发现基因组大小与GC含量的相关性确实受这些因素的影响,而寄生原核生物中显示出最好的相关性。

关 键 词:原核生物  基因组大小  GC含量  生活习性  相关/回归分析
收稿时间:2010-08-05;

Correlation Between Genome Size and GC Content in Prokaryotes with Different Lifestyles
LIN Han,HUANG Yazhi,ZHANG Shanghong.Correlation Between Genome Size and GC Content in Prokaryotes with Different Lifestyles[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni,2011,50(3).
Authors:LIN Han  HUANG Yazhi  ZHANG Shanghong
Institution:(The Key Laboratory of Gene Engineering of Ministry of Education∥Biotechnology Research Center,Sun Yat sen University, Guangzhou 510275,China)
Abstract:Researches of prokaryotic genomes have led to the discovery of the correlation of genomic GC content with genome size and aerobics/anaerobics.In order to study the influence of lifestyle of prokaryotes on the correlation between genome size and genomic GC content,we analyzed the effect of optimal growth temperature,aerobics/anaerobics,motility,aquatics,and parasitism,using data from 411 representative prokaryotic species(including archaea and bacteria) and correlation/regression approaches.The results show ...
Keywords:prokaryote  genome size  GC contents  lifestyle  correlation/regression analysis  
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