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人类DNA序列图形化参数的提取和应用
引用本文:奚襄君,符维娟,汪源源. 人类DNA序列图形化参数的提取和应用[J]. 复旦学报(自然科学版), 2005, 44(6): 960-963,970
作者姓名:奚襄君  符维娟  汪源源
作者单位:复旦大学,电子工程系,上海,200433;复旦大学,电子工程系,上海,200433;复旦大学,电子工程系,上海,200433
摘    要:在DNA序列郝柏林图形化表示方法的基础上,提取出表征图形特征的两个量化参数:信息熵和分形盒维.对人类基因序列和非基因序列各50个片段进行郝柏林图形化和特征参数的提取,结果表明:这两个参数具有区分人类基因序列和非基因序列的统计规律.

关 键 词:DNA序列  郝柏林图  信息熵  分形盒维  统计规律
文章编号:0427-7104(2005)06-0960-04
收稿时间:2004-09-14
修稿时间:2004-09-14

Extraction of Graphical Parameters of Human DNA Sequences and Its Application
XI Xiang-jun,FU Wei-juan,WANG Yuan-yuan. Extraction of Graphical Parameters of Human DNA Sequences and Its Application[J]. Journal of Fudan University(Natural Science), 2005, 44(6): 960-963,970
Authors:XI Xiang-jun  FU Wei-juan  WANG Yuan-yuan
Affiliation:Department of Electronic Engineering, Fuclan University, Shanghai 200433, China
Abstract:Two parameters,information entropy and box dimension of fractals,are extracted from Hao's graphical representation of DNA sequences.This method is applied to human gene and non-gene sequences,50 sample segments apiece.The statistical result shows that these two parameters may be used to distinguish gene sequences from non-gene ones of human genomes.
Keywords:DNA sequences  Hao's graphs  information entropy  box dimension of fractals  statistical characteristics
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