简并引物法克隆保加利亚乳杆菌β-N-乙酰氨基己糖苷酶基因 |
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引用本文: | 崔文明,刘 鹭,张书文,逄晓阳,李红娟,吕加平.简并引物法克隆保加利亚乳杆菌β-N-乙酰氨基己糖苷酶基因[J].北京工商大学学报(自然科学版),2013,31(1):33-37. |
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作者姓名: | 崔文明 刘 鹭 张书文 逄晓阳 李红娟 吕加平 |
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作者单位: | 中国农业科学院农产品加工研究所/农业部农产品加工综合性重点实验室,北京,100193 |
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基金项目: | 国家"十二五"科技支撑计划项目 |
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摘 要: | β-N-乙酰氨基己糖苷酶(β-Hexcase)在细菌、植物和动物中广泛存在,具有典型的外切酶活性并可以催化切除β-N-乙酰氨基己糖的非还原性氨基己糖残基,在细菌细胞分裂中具有重要作用.选取与保加利亚乳杆菌LJJ亲缘关系近的菌种的β-N-乙酰氨基己糖苷酶蛋白序列,利用ICO-DEHOP和CODEHOP在线简并引物设计软件设计β-Hexcase简并引物,选取Hex1-f和Hex1-r引物对,以LJJ基因组DNA为模板经PCR扩增得到614 bp产物.PCR产物连接pGEM-T质粒载体后克隆至大肠杆菌DH5α中,筛选阳性克隆提取质粒进行测序.测序结果显示产物长度为614 bp,该DNA序列经blastx比对发现与其他已知β-Hexcase基因具有相似性,表明所克隆的序列即为LJJβ-Hexcase的基因片段.β-N-乙酰氨基己糖苷酶基因的获得为进一步研究β-N-乙酰氨基己糖苷酶与保加利亚乳杆菌自溶的关系奠定了基础.
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关 键 词: | 保加利亚乳杆 N-乙酰氨基己糖苷酶 简并引物 |
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