| HIV-1蛋白酶与抑制剂BEB的结合自由能计算 |
| |
| 引用本文： | 时术华,张庆刚.HIV-1蛋白酶与抑制剂BEB的结合自由能计算[J].山东师范大学学报(自然科学版),2010,25(2):40-43. |
| |
| 作者姓名： | 时术华 张庆刚 |
| |
| 作者单位： | 1. 山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南;山东建筑大学理学院,250101,济南
2. 山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南 |
| |
| 摘 要： | HIV-1蛋白酶(PR)是治疗艾滋病的重要靶标酶之一.笔者采用分子动力学模拟,运用MM-PBSA方法计算了PR与抑制剂BEB复合物的绝对结合自由能;运用能量分解的方法考察了PR的主要残基与BEB间的相互作用与识别,结果表明:残基GLY27、 ALA28/ALA28'、 GLY49、 ILE50/ ILE50'和ILE84/ ILE84'为PR与BEB的结合自由能提供了主要贡献.抑制剂BEB骨架上的OH基和NH基与残基ASP25/ASP25'、ASP29和GLY27之间的氢键相互作用有利于复合物的稳定.计算结果与实验值吻合较好.
|
| 关 键 词： | HIV-1蛋白酶 抑制剂 分子动力学 结合自由能 |
FREE ENERGY ANALYSIS OF INTERACTION BETWEEN HIV-1 PROTEASE AND INHIBITOR BEB |
| |
| Shi Shuhua,Zhang Qinggang.FREE ENERGY ANALYSIS OF INTERACTION BETWEEN HIV-1 PROTEASE AND INHIBITOR BEB[J].Journal of Shandong Normal University(Natural Science),2010,25(2):40-43. |
| |
| Authors: | Shi Shuhua Zhang Qinggang |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | MM-PBSA |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
