基于非依赖数据采集的呼出气冷凝液蛋白质组加权基因共表达网络分析 |
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引用本文: | 马琳,孙东晓,镇华君,修光利.基于非依赖数据采集的呼出气冷凝液蛋白质组加权基因共表达网络分析[J].华东理工大学学报(自然科学版),2022(5):649-656. |
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作者姓名: | 马琳 孙东晓 镇华君 修光利 |
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作者单位: | 1. 华东理工大学国家环境保护化工过程环境风险评价与控制重点实验室;2. 宾夕法尼亚州立大学医学院质谱中心 |
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基金项目: | 上海市浦江人才计划资助项目(20PJ1402700); |
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摘 要: | 呼出气冷凝液(Exhaled Breath Condensate, EBC)是一种呼吸道衬液,其收集过程无创、便捷,常常被作为肺部疾病研究的载体。建立了基于DIA(Data-Independent Acquisition)的EBC蛋白组学方法,共鉴定到2 052个蛋白。通过加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis, WGCNA)筛选出61个关键蛋白,分析发现这些关键蛋白活跃参与多个与人类疾病相关的代谢通路。结果表明,基于DIA的EBC蛋白组学方法,结合WGCNA分析,可以有效地挖掘出EBC中与疾病相关的生物标志物,未来可应用于大规模的临床研究。
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关 键 词: | 呼出气冷凝液 非依赖数据采集 加权基因共表达网络分析 蛋白质组学 生物信息学 |
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