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改进的β-NMF在基因聚类中的应用
引用本文:
游春芝,崔建.改进的β-NMF在基因聚类中的应用[J].重庆工商大学学报(自然科学版),2018,35(5):46-50.
作者姓名:
游春芝
崔建
作者单位:
山西医科大学汾阳学院基础医学部
摘 要:
针对基因表达数据高维、高噪声等特点,提出了一种基于正交约束的负矩阵分解算法;该算法将正交约束引入到β散度矩阵分解的准则函数中进行优化求解,用梯度下降方法得出矩阵分解的乘积迭代规则,并利用分解项来降低特征空间的维度,将得到的向量用于K均值聚类;实验中选择5种肿瘤基因表达数据,实验结果表明:改进的算法分解所得矩阵在聚类效果上明显优于其他的方法.
关 键 词:
散度
正交约束
梯度下降
聚类
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