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用计算机对人类TSPYl基因P53结合位点的鉴定
引用本文:舒坤贤 谭军 张继承 谢永芳 李鸿健. 用计算机对人类TSPYl基因P53结合位点的鉴定[J]. 重庆邮电学院学报(自然科学版), 2005, 17(6): 718-720
作者姓名:舒坤贤 谭军 张继承 谢永芳 李鸿健
作者单位:重庆邮电学院,重庆400065
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30000084);重庆邮电学院青年教师基金资助项目(A2005-22).
摘    要:根据p53下游基因在其调节区域(启动子或内含子)含有与P53蛋白特异性结合的一致性序列5’-RRRCWWGYYYN(0-13)RRRCWWGYYY-3’,R—G或A,W—T或A,Y—C或T,N—A,C,T,G。用计算机对人类基因组中P53结合位点进行了研究,发现Y染色体上的TSPY1基因内含子中含有这样的一致性序列5’-GGGCTAGTTTtgGAGCTAGCCT-3’,意味着TSPY1基因有可能是一个p53下游基因。

关 键 词:p53基因 p53下游基因 TSPY1基因
文章编号:1004-5694(2005)06-0718-03
收稿时间:2005-05-30
修稿时间:2005-11-01

Computational method for identification of DNA binding sequence for wild-type P53 in the human TSPY1
SHU Kun-xian,TAN Jun, ZHANG Ji-cheng,XIE Yong-fang,LI Hong-jian. Computational method for identification of DNA binding sequence for wild-type P53 in the human TSPY1[J]. Journal of Chongqing University of Posts and Telecommunications(Natural Sciences Edition), 2005, 17(6): 718-720
Authors:SHU Kun-xian  TAN Jun   ZHANG Ji-cheng  XIE Yong-fang  LI Hong-jian
Affiliation:Chongqing University of Posts and Telecorn ,Chongqing 400065 ,P. R. China
Abstract:It's known that p53 downstream genes in the regulatory region(promoter or intron) contain p53 consensus binding sequence,5' RRRCWWGYYYN(0-13) RRRCWWGYYY-3',R=G or A,W=T or A,Y=C or T,N=A,C,T,G.The authors analyse DNA binding sequence for wild-type P53 in human genome by Computational method and discover that there is a consensus sequence,5'-GGGCTAGTTTtgGAGCTAGCCT-3',in intron 2 of the TSPY1(testis specific protein,Y-linked 1) genes in hunan chromosome Y.It suggests that TSPY1 gene may be a p53 downstream gene.
Keywords:p53 gene   p53 downstream gene  TSPY1 gene
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