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以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理
引用本文:王四华,黄可君,张光亚. 以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理[J]. 华侨大学学报(自然科学版), 2013, 0(2): 169-175
作者姓名:王四华  黄可君  张光亚
作者单位:华侨大学化工学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(20806031);福建省自然科学基金资助项目(2007J0360);福建省高校新世纪优秀人才支持计划项目(07176C02);华侨大学基本科研业务费专项基金资助项目(JB-GJ1006)
摘    要:通过分子动力组学的方法,从原子尺度上分析4组嗜盐酶及其同源非嗜盐酶的分子动力学特性.结果发现:嗜盐酶所形成的盐桥和氢键明显多于非嗜盐酶,嗜盐酶的溶剂可及性表面要小于非嗜盐酶.通过比较嗜盐与非嗜盐的均方根偏差、回旋半径及末端距等参数,发现嗜盐酶的结构较非嗜盐酶更具刚性.同时,非嗜盐酶多个部位的氨基酸残基柔性比嗜盐酶的要大很多.研究表明:能形成较多的盐桥、氢键,较小的溶剂可及性表面和整体结构的刚性,很可能是嗜盐酶在高盐环境中维持其结构稳定的主要原因.

关 键 词:嗜盐酶  非嗜盐酶  动力组学  分子动力学模拟  嗜盐机理

Halophilic Mechanism of the Halophilic Enzymes Based on the Molecule Dynameomics Method
WANG Si-hua,HUANG Ke-jun,ZHANG Guang-ya. Halophilic Mechanism of the Halophilic Enzymes Based on the Molecule Dynameomics Method[J]. Journal of Huaqiao University(Natural Science), 2013, 0(2): 169-175
Authors:WANG Si-hua  HUANG Ke-jun  ZHANG Guang-ya
Affiliation:(College of Chemical Engineering,Huaqiao University,Xiamen 361021,China)
Abstract:
Keywords:
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