大豆内生细菌种群多样性PCR-DGGE分析方法的优化研究 |
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引用本文: | 孟利强,赵晓宇,张先成,李晶,张淑梅,曹旭,沙长青.大豆内生细菌种群多样性PCR-DGGE分析方法的优化研究[J].黑龙江大学自然科学学报,2013(3):390-395. |
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作者姓名: | 孟利强 赵晓宇 张先成 李晶 张淑梅 曹旭 沙长青 |
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作者单位: | 黑龙江省科学院微生物研究所黑龙江省生物工程重点实验室;黑龙江省科学院条件财务处 |
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基金项目: | 哈尔滨市科技创新人才研究专项资金项目(2012RFXYN025);黑龙江省科学院青年创新基金项目(2011HK009) |
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摘 要: | 建立了一种适合研究大豆内生细菌种群结构的PCR-DGGE分析方法,筛选适合分析大豆内生细菌的引物,采用巢氏PCR方法获得内生细菌16S rDNA的V6、V7、V8三个高变区,通过优化DGGE技术的变性梯度范围、电泳时间和上样量的大小来获得最佳的DGGE条带图谱。经过优化确定了适合大豆内生细菌研究的引物为968F-1378R,变性剂梯度为40%~60%,且在电压180 V时电泳时间6 h最为合适,上样量为15μL时可获得高分别率的DGGE条带。
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关 键 词: | 大豆 内生细菌 基因组 多样性 PCR-DGGE |
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