| 人类CCR2的同源模建和分子动力学模拟 |
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| 引用本文： | 邓芳轶.人类CCR2的同源模建和分子动力学模拟[J].云南民族大学学报(自然科学版),2004,13(4):313-317. |
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| 作者姓名： | 邓芳轶 |
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| 作者单位： | 云南民族大学,化学与生物技术学院,云南,昆明,650031 |
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| 摘 要： | CCR2是一种单核细胞化学引诱蛋白的受体,在各种疾病感染,发炎,损伤中起着重要作用,也是艾滋病感染的一种共同受体.通过同源模建和1ns限制下的分子动力学模拟,获得了人类CCR2(hCCR2)的一个3D模型,对这个模型进行结构分析并计算出N末端残基的Cα原子离开平衡位置的平均距离,其结果显示,这个模型的主要功能区位于1MLSTSRSRFIRNT NESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIG42区域.
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| 关 键 词： | CCR2 分子动力学 同源模建 趋化因子 |
| 文章编号： | 1672-8513(2004)04-0313-05 |
| 修稿时间： | 2003年12月8日 |
Homology modeling and modecular dynamics simulation of CCR2b |
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| DENG Fang-yi.Homology modeling and modecular dynamics simulation of CCR2b[J].Journal of Yunnan Nationalities University:Natural Sciences Edition,2004,13(4):313-317. |
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| Authors: | DENG Fang-yi |
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| Abstract: | CCR2b, a chemokine receptor for MCP-1,-2, -3, -4, plays an important role in a variety of diseases involving infection ,inflammation ,and injury ,as well as being a coreceptor for HIV-1 infection. A 3D model of human CCR2b (hCCR2b) was generated by homology modeling and 1ns restrained molecular dynamics (MD) simulation . In the model , the potential (C32-C277) disulfide bond was formed .Analysis of the structures and averaged displacements of Ca atoms of N-terminal residues shows that the main functional region of the model lie in 1MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIG42 |
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| Keywords: | CCR2 molecular dynamics homology modeling chemokines |
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