| 水稻基因结构分析与预测建模 |
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| 引用本文： | 周艳红,朱建丽,马闯,程遥.水稻基因结构分析与预测建模[J].华中科技大学学报(自然科学版),2008,36(4):62-64. |
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| 作者姓名： | 周艳红 朱建丽 马闯 程遥 |
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| 作者单位： | 华中科技大学,生物信息与分子成像湖北省重点实验室,湖北,武汉,430074 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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教育部跨世纪优秀人才培养计划
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科技部科技基础条件平台建设计划 |
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| 摘 要： | 将水稻基因结构预测问题划分为基因级、元件级和特征级等多个层次上的一系列较简单子问题,分析了各特征与序列C G含量之间的依赖关系,通过采用从简单到复杂逐级优化的策略建立了不同序列C G含量的水稻基因结构模型,设计了基因结构寻优的动态规划算法,开发了水稻基因结构预测软件Rice-GenePRE.采用测试数据集OsSNG550对该软件进行测试的结果显示:RiceGenePRE在核苷酸、外显子和基因水平上的预测效果均优于水稻基因结构预测系统FGENESH.
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| 关 键 词： | 基因结构预测 水稻基因组 C G含量 多级优化 |
Analysis and predictive model of rice gene structures |
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| Zhou Yanhong,Zhu Jianli,Ma Chuang,Cheng Yao.Analysis and predictive model of rice gene structures[J].JOURNAL OF HUAZHONG UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY.NATURE SCIENCE,2008,36(4):62-64. |
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| Authors: | Zhou Yanhong Zhu Jianli Ma Chuang Cheng Yao |
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