使用多特征预测蛋白质棕榈化位点 |
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作者单位: | ;1.陕西理工学院化学与环境科学学院;2.汉中市产品质量监督检验所 |
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摘 要: | 采用改进的氨基酸组成、SARAH1疏水尺度值、改进的二肽频率特征、间隔氨基酸对组成特征、蛋白质物理化学性质的自相关函数特征值表征给定的蛋白质序列段,然后用小波频谱来提取特征参数值,用支持向量机来预测棕榈酰化位点。模型查准率为0.880,查全率为0.859,F值为0.869,ROC曲线的面积为0.87。研究结果表明,使用多特征预测蛋白质棕榈化位点方法达到了现有预测算法的水平,能够较准确地预测蛋白质棕榈化位点。
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关 键 词: | 棕榈化 位点 蛋白质 |
Prediction of palmitoylation sites using multiple protein sequence characteristics |
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Abstract: | |
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