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使用多特征预测蛋白质棕榈化位点
作者单位:;1.陕西理工学院化学与环境科学学院;2.汉中市产品质量监督检验所
摘    要:采用改进的氨基酸组成、SARAH1疏水尺度值、改进的二肽频率特征、间隔氨基酸对组成特征、蛋白质物理化学性质的自相关函数特征值表征给定的蛋白质序列段,然后用小波频谱来提取特征参数值,用支持向量机来预测棕榈酰化位点。模型查准率为0.880,查全率为0.859,F值为0.869,ROC曲线的面积为0.87。研究结果表明,使用多特征预测蛋白质棕榈化位点方法达到了现有预测算法的水平,能够较准确地预测蛋白质棕榈化位点。

关 键 词:棕榈化  位点  蛋白质

Prediction of palmitoylation sites using multiple protein sequence characteristics
Abstract:
Keywords:
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