| 苏云金杆菌Ⅰ型抗癌晶体蛋白的分子模建 |
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| 引用本文： | 袁宇熹,张同武,陈智山,林毅. 苏云金杆菌Ⅰ型抗癌晶体蛋白的分子模建[J]. 华侨大学学报(自然科学版), 2009, 30(4) |
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| 作者姓名： | 袁宇熹 张同武 陈智山 林毅 |
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| 作者单位： | 华侨大学,化工学院,福建,泉州,362021;华侨大学,化工学院,福建,泉州,362021;华侨大学,化工学院,福建,泉州,362021;华侨大学,化工学院,福建,泉州,362021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室开放基金资助项目 |
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| 摘 要： | 通过同源建模,得到Ⅰ型抗癌晶体蛋白Parasporin-1的初始三维结构经分子动力学方法优化后,利用Ramachandran Plot检测和结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示,结构模型中的键长、键角及二面角的分布合理,与模板蛋白的主链α碳原子的均方根差值为0.537 592, 在合理范围之内.此外,通过分析Parasporin-1结构域Ⅰ中的β-loop-β结构片段,推测出第2个蛋白酶处理激活位点的位置在两个芳香族疏水性氨基酸F167与Y168之间.
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| 关 键 词： | Ⅰ型抗癌晶体蛋白 同源建模 分子动力学模拟 蛋白酶 激活位点 |
Molecular Modeling of Cancer Cell-Killing Crystal Protein Parasporin-1 from Bacillus thuringiensis |
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| YUAN Yu-xi,ZHANG Tong-wu,CHEN Zhi-shan,LIN Yi. Molecular Modeling of Cancer Cell-Killing Crystal Protein Parasporin-1 from Bacillus thuringiensis[J]. Journal of Huaqiao University(Natural Science), 2009, 30(4) |
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| Authors: | YUAN Yu-xi ZHANG Tong-wu CHEN Zhi-shan LIN Yi |
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| Affiliation: | College of Chemical Engineering;Huaqiao University;Quanzhou 362021;China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Parasporin-1 homology modeling molecular dynamics simulation proteinase K-digested sites |
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