| 虎纹蛙病毒的ATP酶基因克隆和序列分析 |
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| 引用本文： | 苗素英,张旻,叶巧真,王晓红,江静波. 虎纹蛙病毒的ATP酶基因克隆和序列分析[J]. 中山大学学报(自然科学版), 2003, 42(2): 74-77 |
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| 作者姓名： | 苗素英 张旻 叶巧真 王晓红 江静波 |
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| 作者单位： | 中山大学生命科学学院,广东,广州,510275 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金资助项目(990255) |
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| 摘 要： | 利用对应于蛙病毒—3型(FV3）ATP酶基因(ATPase)的162—178nt和1186—1174ntt碱基序列作为引物，采用PCR方法扩增得到虎纹蛙病毒(RTV)的ATP酶基因，并对该基因进行克隆、测序和分析。基因读码框大小为945hp，预计可编码一相对分子质量为35500的蛋白质。氨基酸序列比较结果，RTV的ATPase基因与虹彩病毒科蛙病毒属的代表种FV3的一致性最高，为87．9％，与该科其它脊椎动物病毒的一致性在50％-52％之间。ATP酶蛋白质结构域分析可知该基因编码的ATP酶含有Walker型ATP酶AAA族蛋白质的全部结构域，其中既具有Walker型ATP酶所具有的Walker a和Walker b保守区，还含有AAA族蛋白质基因所具有的SRH高度保守区，因此，该基因是一完整的活性蛋白编码基因。
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| 关 键 词： | 虎纹蛙病毒 虹彩病毒科 ATP酶基因 基因克隆 序列分析 氨基酸序列 水产养殖 病原 |
| 文章编号： | 0529-6579(2003)02-0074-04 |
| 修稿时间： | 2002-05-23 |
Cloning and Analysis of RTV ATPase Gene |
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| MIAO Su-ying,ZHANG Min,YE Qiao-zhen,WANG Xiao-hong,JIANG Jing-bo. Cloning and Analysis of RTV ATPase Gene[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni, 2003, 42(2): 74-77 |
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| Authors: | MIAO Su-ying ZHANG Min YE Qiao-zhen WANG Xiao-hong JIANG Jing-bo |
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| Abstract: | The putative adenosine triphosphatase (ATPase) gene of Rana tigrina ranavirus (RTV) was amplificated, cloned and sequenced. The ORF of ATPase gene consists of 945 bp, which codes for a protein of 315 aa with a predicted molecular mass of 35 500. The identity of the ATPase gene was 88% and 52% to that of frog virus 3 (FV3) and lymphocystis disease virus (LCDV-1), respectively. The RTV ATPase protein was belonged to AAA (for ATPase associated with diverse cellular activities) protein family of the Walker-type ATPases. There were all of three highly conserved motifs (Walker A, Walker B and SRH) of AAA protein within the amino acid sequence of the RTV ATPase. |
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| Keywords: | Rana tigrina ranavirus ATPase gene clone sequence analysis |
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