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细菌和酵母基因组中ORF结构特征的统计分析
引用本文:胡秀珍,李宏.细菌和酵母基因组中ORF结构特征的统计分析[J].华中科技大学学报(自然科学版),2003,31(5):104-106.
作者姓名:胡秀珍  李宏
作者单位:1. 内蒙古工业大学物理系
2. 内蒙古大学理工学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目 (1 0 1 472 0 4),内蒙古自然科学基金资助项目 (2 0 0 0 1 3 0 1 )
摘    要:将第一ATG规则用于细菌Hpyl,Hpyl99,E.coli,Aero,Tmar和Yeast基因组中,并用给出ORF(包含已知基因编码区)进行检验,其结果对以ATG起始的ORF序列正确率皆为89%以上,将五种细菌和酵母基因组中给出ORF分成第一种(已确定的编码序列)和第二种(还未确定为编码序列的)ORF,并计算L—Ter到第一ATG的平均距离,分析了五种细菌和酵母终止密码子在L-Ter位置和Ter位置上的使用频率,发现在Ter位置上终止密码子使用的偏置程度比在L-Ter位置上大.

关 键 词:第一ATG规则ATG和非ATG起始的密码子  终止密码子的偏置  基因组
文章编号:1671-4512(2003)05-0104-03
修稿时间:2002年3月13日

The structural characters of ORFS in the bacteria and yeast genomes
Hu Xiuzhen Li Hong Hu Xiuzhen Assoc. Prof., Dept. of Physics,Inner Mongolia Polytechnic University,Huhhot ,China..The structural characters of ORFS in the bacteria and yeast genomes[J].JOURNAL OF HUAZHONG UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY.NATURE SCIENCE,2003,31(5):104-106.
Authors:Hu Xiuzhen Li Hong Hu Xiuzhen Assoc Prof  Dept of Physics  Inner Mongolia Polytechnic University  Huhhot  China
Institution:Hu Xiuzhen Li Hong Hu Xiuzhen Assoc. Prof., Dept. of Physics,Inner Mongolia Polytechnic University,Huhhot 010062,China.
Abstract:
Keywords:the first ATG rule  start codon  terminal codon  genomes
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