| 胃癌芯片数据中异常转录因子推断与信号通路分析 |
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| 引用本文： | 王立荣,江朝晖,许文龙,冯焕清.胃癌芯片数据中异常转录因子推断与信号通路分析[J].中国科学技术大学学报,2007,37(12):1539-1542. |
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| 作者姓名： | 王立荣 江朝晖 许文龙 冯焕清 |
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| 作者单位： | 中国科学技术大学电子科学与技术系,安徽合肥,230026 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划);中国科技大学建设一流大学重点项目 |
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| 摘 要： | 用一种新的转录因子介导的信号通路分析方法分析肿瘤芯片数据,从中推断异常的转录因子和信号通路.先通过统计目标基因的表达推断转录因子的活性,然后将那些活性异常的转录因子映射到KEGG信号通路上.此方法整合了基因表达调控的实验数据和信号通路信息.利用此方法,对斯坦福芯片数据库中的162个人类胃癌数据进行分析,结果发现,大部分芯片中的TGF-beta,JAK-STAT,NF-kappaB和Notch信号通路被异常激活.进一步对这些通路进行研究,将有助于探究胃癌的发生、发展机理和进行合理的药物设计.
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| 关 键 词： | 转录因子 信号通路 癌症 微阵列 |
| 文章编号： | 0253-2778（2007）12-1539-04 |
| 收稿时间： | 2007-03-02 |
| 修稿时间： | 2007-03-09 |
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