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水稻基因组DNA总甲基化水平测定方法
引用本文:陈强,辛士刚,王俊伟,徐昕,李玥莹,李雪梅. 水稻基因组DNA总甲基化水平测定方法[J]. 沈阳师范大学学报(自然科学版), 2011, 29(4): 560-563. DOI: 10.3969/j.issn.1673-5862.2011.04.024
作者姓名:陈强  辛士刚  王俊伟  徐昕  李玥莹  李雪梅
作者单位:1. 沈阳师范大学实验中心,沈阳,110034
2. 沈阳师范大学工程技术学院,沈阳,110034
3. 沈阳师范大学化学与生命科学学院,沈阳,110034
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30870205)
摘    要:对高效液相色谱法测定DNA总甲基化水平的关键因素进行研究,即基因组DNA的提取及纯化和高效液相色谱条件的选择。结果表明:CTAB法Ⅰ提取和纯化效果优于CTAB法Ⅱ;较优高效液相色谱条件为:采用Diamonsil C18(2)(250 mm×4.6 mm,5μm)的色谱柱,以甲醇-10 mmol/L磷酸二氢钾(10-90,v/v)为流动相构成,流动相pH为4.7,流速为0.5 mL/min,柱温为30℃,紫外检测器波长为285 nm时,是分离胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的较优条件。以试验优化的DNA提取方法和HPLC色谱条件,基因组DNA水解液的胞嘧啶(C)和5-甲基胞嘧啶(5 mC)可得到较好的分离效果。

关 键 词:DNA甲基化  高效液相色谱法  5-甲基胞嘧啶  胞嘧啶  流动相

On method for determination of total level of DNA methylation in rice
CHEN Qiang,XIN Shi-gang,WANG Jun-wei,XU Xin,LI Yue-ying,LI Xue-mei. On method for determination of total level of DNA methylation in rice[J]. Journal of Shenyang Normal University(Natural Science Edition), 2011, 29(4): 560-563. DOI: 10.3969/j.issn.1673-5862.2011.04.024
Authors:CHEN Qiang  XIN Shi-gang  WANG Jun-wei  XU Xin  LI Yue-ying  LI Xue-mei
Affiliation:CHEN Qiang1,XIN Shi-gang1,WANG Jun-wei2,XU Xin1,LI Yue-ying3,LI Xue-mei3(1.Experimental Center,Shenyang Normal University,Shenyang 110034,China,2.College of Engineering,3.College of Chemistry and Life Science,China)
Abstract:
Keywords:DNA methylation  high performance liquid chromatography  5-methylcytosine  cytosine  mobile phase  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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