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毛茛铁线莲叶绿体全基因组解析及系统发育分析
作者姓名:王若澜  张德全
作者单位:1. 大理大学药学院;2. 云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室
基金项目:国家自然科学基金资助项目(32060091);;云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2105AC160063);
摘    要:为了解析药用植物毛茛铁线莲的叶绿体全基因组特征及系统发育位置,利用高通量测序技术对毛茛铁线莲叶片样品进行测序,并对毛茛铁线莲叶绿体基因组进行组装、注释和特征分析,采用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)及贝叶斯法(BI)构建分子系统发育树.结果表明,毛茛铁线莲的叶绿体基因组为典型的四分体结构,全长159 741 bp,共编码112个基因,包括79个蛋白编码基因、29个tRNA基因和4个rRNA基因;毛茛铁线莲叶绿体基因组共含有84个简单重复序列,以单核苷酸重复基序居多,共57个;毛茛铁线莲叶绿体基因组使用频次最高的氨基酸是亮氨酸;基于叶绿体全基因组构建的MP,ML和BI树,拓扑结构基本一致;铁线莲属是明显的单系类群,与银莲花属关系最近,毛茛铁线莲与绣球藤亲缘关系最近.

关 键 词:毛茛铁线莲  叶绿体基因组  简单重复序列  系统发育  毛茛科
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