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HIV辅助受体CCR5常见小分子抑制剂抑制效果的综合评价
引用本文:焦诗卉,何淼.HIV辅助受体CCR5常见小分子抑制剂抑制效果的综合评价[J].中山大学学报(自然科学版),2012,51(6).
作者姓名:焦诗卉  何淼
作者单位:中山大学生命科学学院,广东广州,510275
基金项目:国家自然科学基金重大研究计划培育资助项目,广东省科技计划项目重大专项资助项目
摘    要:通过系统比较CCR5常见小分子抑制剂的抑制效果,寻找CCR5的优化对接靶点,筛选最优抑制剂,为新型抑制剂的研发提供理论依据.基于Material Studio软件,我们构建了7类29种小分子抑制剂的三维结构,全面模拟了各种抑制剂与CCR5对接的效果;利用分子对接绝对自由能、相对自由能、对接姿态百分比和LibDock综合得分等参数评估小分子抑制剂的抑制效果.研究初步发现,CCR5小分子抑制剂的最优对接位点是第二个胞外环与N末端之间的site4.小分子抑制剂的抑制效果由强到弱排序依次为:抑制剂27(吡咯烷类)、抑制剂8(苯并环庚烯类)、抑制剂12(哌啶类)、抑制剂14(螺环二酮哌啶类)、抑制剂21(4-哌啶-1-丁胺类)、抑制剂5(天然小分子类)和抑制剂17(托品烷类);其研究表明,吡咯烷类抑制剂27可能成为CCR5最优抑制剂候选对象.

关 键 词:discovery  studio  CCR5  HIV-1  小分子抑制剂

Inhibition Evaluation of Common Small Molecule Inhibitors of CCR5 for HIV
JIAO Shihui , HE Miao.Inhibition Evaluation of Common Small Molecule Inhibitors of CCR5 for HIV[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni,2012,51(6).
Authors:JIAO Shihui  HE Miao
Abstract:
Keywords:
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