基于转录组数据对糙苏三萜皂苷合成途径的研究 |
| |
引用本文: | 李晓敏,赵春艳,杨天为,熊勇.基于转录组数据对糙苏三萜皂苷合成途径的研究[J].云南民族大学学报(自然科学版),2023(2):165-174. |
| |
作者姓名: | 李晓敏 赵春艳 杨天为 熊勇 |
| |
作者单位: | 1. 云南民族大学民族医药学院;2. 中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金(81760655); |
| |
摘 要: | 糙苏为我国民间常用的传统草药,具有消肿、续筋接骨、祛风化痰、通络止痉、安胎等作用,三萜皂苷类化合物为其主要的生物活性成分.对糙苏组织转录组测序,挖掘其三萜皂苷生物合成途径相关基因,探究糙苏三萜皂苷化合物生物合成的分子基础.利用Trinity软件对测序结果获得的Unigenes数据进行过滤组装,并结合KEGG、GO数据库对Unigenes进行注释,预测糙苏三萜皂苷代谢的生物合成途径关键基因.结果获得了参与萜类化合物骨架生物合成的Unigenes数量为73条,39条Unigenes编码19个与萜类生物合成的关键酶,且有23条基因参与萜类物质骨架代谢途径(途径编号为ko00900),19条基因参与了倍半萜类物质代谢途径(途径编号为ko00909),涉及萜类物质骨架合成代谢途径相关酶共有15种,以及三萜代谢途径相关酶有10种.本研究获取了糙苏的三萜皂苷合成相关候选基因核苷酸和氨基酸序列,为糙苏三萜皂苷物质体外表达和生物合成奠定理论基础.
|
关 键 词: | 糙苏 三萜皂苷 生物合成 转录组测序 |
|
|