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日本赭纤虫第一类肽链释放因子C端结构域分析
引用本文:陈洁,梁爱华,杨斌盛.日本赭纤虫第一类肽链释放因子C端结构域分析[J].山西大学学报(自然科学版),2012(3):546-551.
作者姓名:陈洁  梁爱华  杨斌盛
作者单位:山西大学 生物技术所 化学生物学与分子工程教育部重点实验室;山西大学 分子科学研究所 化学生物学与分子工程教育部重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(31071924);山西省自然科学基金(2009011059-3;2010011040-1)
摘    要:eRF1的C结构域与eRF3的C结构域相互作用对于蛋白质翻译终止过程中的快速反应至关重要.通过计算机同源建模对日本赭纤虫第一类肽链释放因子C结构域Bj-eRF1C进行结构模拟,发现在Bj-eRF1C结构域中有些肽段直接参与了eRF1-eRF3相互作用,特别是Bj-eRF1C结构域中V294和D297位点高度保守.通过定点突变与pull-down分析,表明在Bj-eRF1C结构域中V294和D297是eRF1-eRF3相互作用的关键位点.

关 键 词:日本赭纤虫  eRF1  同源建模  eRF1-eRF3相互作用

Study on Structure and Function of Class Ⅰ Polypeptide Release Factor C Domain in Blepharisma japonicum
CHEN Jie,LIANG Ai-hua,YANG Bin-sheng.Study on Structure and Function of Class Ⅰ Polypeptide Release Factor C Domain in Blepharisma japonicum[J].Journal of Shanxi University (Natural Science Edition),2012(3):546-551.
Authors:CHEN Jie  LIANG Ai-hua  YANG Bin-sheng
Institution:1.Institute of Biotechnology,Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering of Ministry of Education,Shanxi University,Taiyuan 030006,China; 2.Institute of Molecular Science,Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering of Ministry of Education,Shanxi University,Taiyuan 030006,China)
Abstract:The C domain of eRF1 interacts with the C domain of eRF3.This interaction is essential for fast kinetics of the protein translation termination.In this study,the eRF1-eRF3 interaction binding sites on class Ⅰ polypeptide release factor C domain in Blepharisma japonicum(Bj-eRF1C) were stimulated based on homology modeling.Point mutation analysis were carried out.The results showed that V294 and D297 in Bj-eRF1C domain played an important role on eRF1-eRF3 interaction.
Keywords:Blepharisma japonicum  eRF1  homology modeling  eRF1-eRF3 interaction
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