| 基于特征挖掘与融合的剪接位点识别 |
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| 引用本文： | 周艳红,王卉,杨雷. 基于特征挖掘与融合的剪接位点识别[J]. 华中科技大学学报(自然科学版), 2006, 34(12): 117-120 |
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| 作者姓名： | 周艳红 王卉 杨雷 |
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| 作者单位： | 华中科技大学,生命科学与技术学院,湖北,武汉,430074;华中科技大学,生命科学与技术学院,湖北,武汉,430074;华中科技大学,生命科学与技术学院,湖北,武汉,430074 |
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| 摘 要： | 在基于保守序列这一信号特征识别剪接位点的基础上．挖掘了可用于剪接位点识别的其他多个特征（包括剪接位点上、下游序列的碱基组成。剪接位点信号和上、下游序列的碱基组成随位点邻近序列C＋G含量的变化等统计特征），建立了描述这些特征的模型。设计了能有效融合这些特征对剪接位点进行识别的对数线性模型，开发了剪接位点识别程序SpliceKey．测试结果表明：SpliceKey识别剪接位点的精度不仅较WAM方法有显著的提高，而且也优于国际上最新发布的剪接位点识别软件DGSplice．SpliceKey已提供网络服务：http：／／infosci．hust．edu．cn／SpliceKey／．
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| 关 键 词： | 剪接位点 对数线性模型 C+G含量 权重阵列模型 |
| 文章编号： | 1671-4512（2006）12-0117-04 |
| 收稿时间： | 2005-12-14 |
| 修稿时间： | 2005-12-14 |
Identification of splice sites based on feature mining and integration |
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| Zhou Yanhong,Wang Hui,Yang Lei. Identification of splice sites based on feature mining and integration[J]. JOURNAL OF HUAZHONG UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY.NATURE SCIENCE, 2006, 34(12): 117-120 |
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| Authors: | Zhou Yanhong Wang Hui Yang Lei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | splice site logitlinear model C G content weight array model(WAM) |
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