PCR-DGGE技术在活性污泥细菌多样性中的条件研究 |
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引用本文: | 杨明月,接伟光,蔡柏岩.PCR-DGGE技术在活性污泥细菌多样性中的条件研究[J].黑龙江大学自然科学学报,2014(3):386-391. |
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作者姓名: | 杨明月 接伟光 蔡柏岩 |
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作者单位: | 黑龙江大学生命科学学院黑龙江省普通高等学校微生物重点实验室;黑龙江东方学院食品与环境工程学部;黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心 |
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基金项目: | 黑龙江省普通高等学校青年学术骨干支持计划项目(1254G049);黑龙江省普通高校微生物重点实验室(黑龙江大学)开放课题基金项目(2012MOI-7) |
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摘 要: | 探讨了适用于分析研究活性污泥中细菌多样性的PCR-DGGE实验条件。采用NestedPCR(巢式PCR)技术扩增污泥中细菌的16S rDNA V3区域,利用该扩增产物对污泥中细菌DGGE条件进行优化。结果表明,所采用的Nested-PCR技术准确性较高,可从微量的DNA中扩增出分子大小约190 bp的目标片段。经DGGE条件优化,确定其最佳DGGE条件为丙烯酰胺浓度8.0%,PCR产物作为DGGE上样样品,凝胶变性梯度范围30%~60%,电泳电压140 V,电泳时间8 h,电泳温度60℃。该研究为活性污泥中细菌的PCR-DGGE技术的后序研究提供有效途径。
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关 键 词: | 活性污泥 S rDNA Nested-PCR 变性梯度凝胶电泳 |
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