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冠状病毒和人类SARS病毒的分子亲缘关系研究
引用本文:高雷,戚继,卫海滨,孙奕钢,郝柏林.冠状病毒和人类SARS病毒的分子亲缘关系研究[J].科学通报,2003,48(12):1246-1250.
作者姓名:高雷  戚继  卫海滨  孙奕钢  郝柏林
作者单位:1. 中国科学院理论物理研究所,北京,100080;复旦大学理论生命科学研究中心,上海,200433
2. 浙江大学研究生院,杭州,310027;中国科学院北京基因组研究所杭州分部,杭州,310008
3. 复旦大学理论生命科学研究中心,上海,200433;中国科学院北京基因组研究所杭州分部,杭州,310008
基金项目:本工作为国家重点基础研究发展规划(批准号: G2000077308)、国家自然科学基金(批准号: 30170232)、中国科学院知识创新工程和上海市通过复旦大学提供的资助项目.
摘    要:组分矢量方法是一种从全基因组出发, 研究物种亲缘关系的新方法. 本文使用这一方法, 通过对外类群的适当选取, 研究包括SARS病毒的冠状病毒进化关系. SARS病毒作为一个单系, 由于彼此之间的序列相似程度非常高, 难以为其选取适当的外类群. 我们利用核苷酸的突变计数来构造距离矩阵, 并将其超度规化, 在此基础上揭示SARS病毒自身的演变关系. 本文采用了更多的序列和新的方法, 反映了更为详细的冠状病毒进化关系, 使得不同方法的比较成为可能, 为冠状病毒进化关系的研究提供了新的视角.

关 键 词:严重急性呼吸综合征(SARS)  冠状病毒  分子进化  组分距离  超度规
收稿时间:2003-05-28
修稿时间:2003年5月28日
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