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基于线粒体基因的杂色山雀中国大陆种群遗传多样性研究
引用本文:霍雅鹏,万冬梅,张宇婷,曹君. 基于线粒体基因的杂色山雀中国大陆种群遗传多样性研究[J]. 辽宁大学学报(自然科学版), 2013, 0(4)
作者姓名:霍雅鹏  万冬梅  张宇婷  曹君
作者单位:辽宁大学生命科学院,辽宁沈阳,110036
基金项目:国家自然科学基金项目,辽宁省教育厅重点实验室项目
摘    要:杂色山雀(P arus varius)为东亚特有鸟类、分布呈片段化.为了深入了解杂色山雀中国大陆各地理种群遗传水平现状,分析了杂色山雀8个地方种群49个样本的线粒体Cytb基因全序列(1143bp)和部分ND5基因序列(957 bp),所测样品全长共2.1 kb.结果显示:T、C、A、G碱基的平均含量分别为21.5%、37.4%、28.9%、12.2%,A+T含量(50.4%)略高于G+C含量(49.6%);发现17个变异位点,其中单变异位点为7个,简约信息位点数为10个;检测到14个单倍型,8个地方种群共享一个单倍型(Hap-1),说明这个单倍型是个较古老的单倍型,也反映了这几个群体间的分化是不显著的.5个种群的单倍型多样性为0.822 39,核苷酸多样性为0.000 82,平均核苷酸差异数为4.663 83,总体上看,杂色山雀具有较低的单倍型多样性和核苷酸多样性.五个种群的Nm值为5.282 21~17.33645,Fst值为0.002 07~0.086 47,构建的系统发生树和TCS网络图进一步分析表明杂色山雀遗传多样性较低、基因交流非常频繁、种群间的分化不显著.中性检验显示偏离中性期望值,表明种群在进化的过程中出现过群体急速扩张事件.

关 键 词:杂色山雀  遗传多样性  Cytb基因  单倍型

The Genetic Diversity Research of Parus Varius in Mainland China Based on Mitochondrial Gene
HUO Ya-peng,WAN Dong-mei,ZHANG Yu-ting,CAO Jun. The Genetic Diversity Research of Parus Varius in Mainland China Based on Mitochondrial Gene[J]. Journal of Liaoning University(Natural Sciences Edition), 2013, 0(4)
Authors:HUO Ya-peng  WAN Dong-mei  ZHANG Yu-ting  CAO Jun
Affiliation:HUO Ya-peng WAN Dong-mei ZHANG Yu-ting CAO Jun
Abstract:
Keywords:
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