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基于转录组序列的小麦ETS-SSR标记筛选与染色体定位
作者姓名:杨会  杨在君  魏淑红  廖明莉  杨宇凤  王育伟  王清海  彭正松
作者单位:西华师范大学西南野生动植物资源保护省部共建教育部重点实验室;
基金项目:国家自然科学基金(31301319);四川省教育厅项目(12ZB325);四川省科技厅项目(2012HH0015)2)
摘    要:通过小麦转录组序列分析,获得121 210个非重复序列(Unigenes),在10 672(8.8%)个Unigenes中搜索出1-6个重复基元的11 650条EST-SSR信息位点,筛选并设计出308条SSR引物,选取前30对引物进行合成.有效性扩增检测结果表明,20(66.7%)对引物有清晰条带.利用缺体-四体系共定位了14对引物,分别位于13条染色体的21个位点上.研究表明,利用小麦转录组中EST-SSR信息开发新的SSR标记是可行的,开发的新ESTSSR标记可有效用于小麦基因的定位和遗传多样性的分析等.

关 键 词:转录组测序  EST-SSR  小麦
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