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Nir2碳端结构域的晶体结构
引用本文:俸婷婷,李灵,宋旭,杨元德.Nir2碳端结构域的晶体结构[J].四川大学学报(自然科学版),2009,46(6):1897-1904.
作者姓名:俸婷婷  李灵  宋旭  杨元德
作者单位:1. 四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室,成都,610064
2. 纽维娅有限公司,武汉,430070
基金项目:国家自然科学基金青年基金,教育部博士点基金 
摘    要:Nir2蛋白具有多个结构域,在生物体中可能发挥多种生理功能。本实验用MAD软件对大肠杆菌BL21(plys)原核表达的Nir2蛋白碳端进行了晶体结构分析。结果显示,硒蛋氨酸取代蛋白晶体及未取代蛋白晶体同属空间群P212121,晶胞参数a=109.468 Å, b=120.621 Å, c=70.315 Å,分辨率分别为2.2 Å和2.7 Å。一个不对称单位含有三个分子,含水量为48%。Nir2蛋白碳端由C片层和N片层构成,其中C片层与钙ATPase的催化区域P相似,N片层为许多不相关的功能性蛋白所共有。研究证明二者之间的静电作用是影响Nir2蛋白碳端与Pyk2 FERM区域结合的主要因素。该晶体结构的分析结果为进一步研究Nir2蛋白碳端的潜在功能提供了结构基础。

关 键 词:Nir2蛋白碳端结构域    晶体结构    静电作用    MAD
收稿时间:1/17/2008 8:40:24 PM
修稿时间:3/14/2008 8:12:40 PM

The crystal structure of Nir2 C-terminal domain
FENG Ting-Ting,Li Ling,SONG Xu and YANG Yuan-De.The crystal structure of Nir2 C-terminal domain[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2009,46(6):1897-1904.
Authors:FENG Ting-Ting  Li Ling  SONG Xu and YANG Yuan-De
Institution:Biology of Life Sciences, Sichuan University;Biology of Life Sciences, Sichuan University;Biology of Life Sciences, Sichuan University;Nuvea Company
Abstract:Nir2 is a multiple-domain protein and may play several biological roles. The crystal structure is solved by using MAD method of Nir2 C-terminal domain overexpressed in bacteria E.coli BL21(plys). Both unsubstituted and Selenomethionine-substituted crystals belong to space group P2_12_12_1 (a=109.468(A°), b=120.621(A°), c=70.315(A°), α=β=γ= 90°) and diffract to 2.2(A°)and 2.7(A°), respectively. There are three molecules in one asymmetrical unit and solvent content was 48%. The structure reveals that Nir2 C-terminal domain consists of N lobe and C lobe, the C lobe is similar to the catalytic domain P of calcium ATPase, and N lobe can be found in many functionally unrelated proteins.The results suggest that electrostatic interaction between them is the key factor for the binding of Nir2 C-terminal domain to Pyk2 FERM domain.
Keywords:Nir2 C-terminal domain  crystal structure  electrostatic interaction  MAD
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