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| 葱蝇PDK1基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 申力,郝友进,罗钱春,陈斌 . 葱蝇PDK1基因的克隆及生物信息学分析 [J]. 重庆师范大学学报(自然科学版), 2014, 0(1): 30-36 |
| 作者姓名： | 申力 郝友进 罗钱春 陈斌 |
| 作者单位： | 重庆师范大学 昆虫与分子生物学研究所 重庆市动物生物学重点实验室,重庆401331 |
| 摘 要： | 3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1(3-phosphoinositide-dependent protein kinase1,PDK1)是磷脂酰肌醇3-激酶(Phos-phatidylinositol-3 kinase,PI3K)/蛋白激酶B(PKB/Akt)信号通路中一个关键的激酶。该通路在人(Homo sapiens)、黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中是一条保守的通路,通过激活下游的因子对代谢、细胞分化、寿命等产生重要调节作用。本研究基于葱蝇(Delia antiqua)转录组数据通过生物信息学分析从其中鉴定出PDK1基因4条Unigene序列,并通过PCR技术克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为DaPDK1,其全长为3215bp,开放阅读框长2730bp,编码909个氨基酸。采用生物信息学的方法,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量为100.3kD,等电点为8.53。该蛋白第87~109氨基酸是跨膜区,第284~627和744~833氨基酸是两个保守结构域STKc和PH。同源性分析表明DaPDK1蛋白与地中海实蝇(Ceratitis capitata)PDK1蛋白氨基酸序列相似性最高(一致率为53.1%,相似率为63.2%)。本研究结果有望为进一步研究葱蝇PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础。 |
| 关 键 词： | 葱蝇 PDK1基因 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of the PDK1 Gene In the Onion Maggot, Delia antiqua |
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| SHEN Li,HAO You-Jin,LUO Qian-Chun,CHEN Bin . Cloning and Bioinformatic Analysis of the PDK1 Gene In the Onion Maggot, Delia antiqua [J]. Journal of Chongqing Normal University:Natural Science Edition, 2014, 0(1): 30-36 |
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| Authors: | SHEN Li HAO You-Jin LUO Qian-Chun CHEN Bin |
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