假单胞菌Y5-11的分离筛选及比较基因组学研究

菌株Y5-11是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌，具有较高的自养脱氮能力。菌株Y5-11的16S rRNA基因序列与模式菌Pseudomonas koreensis Ps 9-14^T高度同源(99.72%)。获得了菌株Y5-11的全基因组序列，采用比较基因组学分析了菌株Y5-11的碳源利用和脂肪酸含量特征，对菌株的生理生化特征进行了系统研究，发现菌株Y5-11与模式菌Pseudomonas koreensis Ps 9-14^T在碳源利用上较为接近，但两株菌株在生长温度和硝酸盐还原方面存在差异。菌株Y5-11有17个特有基因，其在脂肪酸种类及含量上与其他菌株相比，存在明显的特异性，主要脂肪酸为C16:0和C17:0 cyclo,含量分别为19.37%和21.09%。通过以上研究，确定了菌株Y5-11的分类地位和生物学特征，为菌株Y5-11的进一步应用提供了生物学参考依据。