| 拟南芥代谢通路下基因调控网络的构建 |
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| 引用本文： | 焦清局,杨仲南,黄继风.拟南芥代谢通路下基因调控网络的构建[J].科学通报,2009,54(23):3710-3715. |
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| 作者姓名： | 焦清局 杨仲南 黄继风 |
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| 作者单位： | 上海师范大学信息与机电工程学院, 上海 200234;
上海师范大学生命与环境科学学院, 上海 200234 |
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| 基金项目： | 上海市教育委员会教育科学研究资助项目(批准号: 07ZZ60) |
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| 摘 要： | 基因调控网络在研究基因之间的调控关系及揭示复杂的生命现象方面有着重要的意义. 拟南芥整个生长过程是由基因网络所调控. 本文利用拟南芥代谢通路下基因共表达这一属性, 结合启动子序列分析的生物信息学方法来预测拟南芥代谢通路下基因的调控关系. 基于这种方法, 一共预测到2268对具有调控关系的基因对, 其中91对为高可信度的调控关系. 在我们预测到的调控关系中, 有4对调控关系已被实验验证, 实验表明本文预测的结果有一定的可靠性. 我们预测的拟南芥代谢通路下基因的调控网络, 为深入研究代谢通路在植物生长过程中所起的作用提供了方便, 有助于进一步研究拟南芥未知基因的功能.
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| 关 键 词： | 拟南芥 代谢通路 基因调控网络 生物信息学 模体 |
| 收稿时间： | 2009-06-18 |
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